私たちは遺伝アルゴリズムの古典的なケースである旅行商問題を選び、遺伝アルゴリズムの具体的な実装を紹介します。
旅行商問題#
一連の都市と各都市間の距離が与えられたとき、各都市を一度訪れ、出発都市に戻る最短のループを求めます。
各都市に座標を設定し、それを用いて各都市間の距離を求めます。グラフ上の問題については、Floyd アルゴリズムを使用してグラフを処理し、各都市間の最短経路を取得します。
グローバル定数、変数定義#
const int SIZE = 1000, CNT = 1000;//集団のサイズと最大世代数
using Pos = pair<double, double>;//座標タイプ
using Rst = vector<int>;//染色体タイプ
vector<Pos> a;//都市座標配列
double ans = 1e9;//グローバル最適解、到達不可能な大きな長さで初期化
Rst ans_rst;//この解に対応する染色体
double notans = 1e9;//現在の集団の最適解(したがって答えではない)
double geneSum = 0;//現在の集団の参加する二元トーナメントのすべての解の合計
int geneCnt = 0;//現在の集団に参加する二元トーナメントの個体数、変わらないようです
//上記の2行は集団の平均解を求めるために使用され、集団の変化を観察します
ツール関数#
//ランダムな浮動小数点数を取得、0~1
double randf() {
return static_cast<float>(rand()) / static_cast<float>(RAND_MAX);
}
//2点間の距離
double getDis(Pos p1, Pos p2) {
return sqrt(pow(p1.first - p2.first, 2) + pow(p1.second - p2.second, 2));
}
主要プロセス#
int main() {
int n;
scanf("%d", &n);
for (int i = 1; i <= n; ++i) {
double tx, ty;
scanf("%lf%lf", &tx, &ty);
a.push_back(make_pair(tx, ty));
}
//上記はデータ入力部分
//全体の集団
vector<Rst> pool;
//ランダムな染色体を生成
for (int i = 1; i <= SIZE; ++i)
pool.push_back(randGene(n));
//CNT世代の繁殖を行う
for (int i = 1; i <= CNT; ++i) {
//このラウンドの統計データを初期化
notans = 1e9;
geneSum = 0;
geneCnt = 0;
printf("%d ", i);
//適応度配列
vector<double> score;
//新しい集団
vector<Rst> new_pool;
for (int i = 1; i <= CNT / 2; ++i) {
//2つの親を選択
auto win1 = choose(pool);
auto win2 = choose(pool);
//20%の確率で交叉を行う
if (randf() < 0.2) {
auto children = oxCross(win1, win2);
win1 = children.first;
win2 = children.second;
}
//変異を試みる、1%の確率で変異
bianYi(win1);
bianYi(win2);
//新しい集団に挿入
new_pool.push_back(win1);
new_pool.push_back(win2);
}
//このラウンドの結果を出力
printf("%lf %lf %lf\n", ans, notans, geneSum / geneCnt);
//集団の変化
pool = new_pool;
}
//最適解の染色体を出力
for (int v : ans_rst)
printf("%d ", v);
return 0;
}
遺伝子コーディングと生成#
旅行商が通過した順序を遺伝子のコーディングとして使用し、染色体は都市の数の長さを持つ 10 進数の列です。
//ランダムに染色体を生成
Rst randGene(int n) {
Rst ret;
unordered_map<int, bool> mp;
for (int i = 1; i <= n; ++i) {
int newr = rand() % n;
while (mp[newr])
newr = rand() % n;
ret.push_back(newr);
mp[newr] = true;
}
return ret;
}
適応度評価#
総距離の逆数を適応度として取ります。この方法で生成された適応度の合計は 1 にはなりません。
//移動した総距離
double getValue(Rst &g) {
int len = g.size();
double s = 0;
for (int i = 1; i < len; ++i)
s += getDis(a[g[i - 1]], a[g[i]]);
s += getDis(a[g[0]], a[g[len - 1]]);
if (s < ans) {
ans = s;
ans_rst = g;
}
if (s < notans)
notans = s;
geneSum += s;
geneCnt++;
return s;
}
//適応度
double getShiYingDu(Rst &g) { return 1.0 / getValue(g); }
選択#
私たちは二元トーナメント方式で選択を行います。つまり、毎回ランダムに 2 つの個体を抽出し、適応度が高い方を保持します。対応して、複数の個体を比較する方法は n 元トーナメントです。
//選択、二元トーナメント
Rst &choose(vector<Rst> &pool) {
int len = pool.size();
int i = rand() % len;
int j = rand() % len;
int big = getShiYingDu(pool[i]) > getShiYingDu(pool[j]) ? i : j;
return pool[big];
}
交叉#
私たちが使用する交叉方式は順序交叉です。個体 2 からランダムに一部分を選び、個体 1 の前に置き、その後の重複遺伝子を取り除きます。次に、別の個体の同じ部分を使用して同様の操作を行います。
例えば 1 5 4 3 2 と 5 3 2 1 4 からランダムに 1 から 3 位を選択すると、得られる子代は 2 1 3 5 4 と 5 4 3 2 1 です。
//順序交叉(Order Crossover)
pair<Rst, Rst> oxCross(Rst &r1, Rst &r2) {
int len = r1.size();
int i = rand() % len, j = i + rand() % (len - i);
Rst s1, s2;
unordered_map<int, bool> mp1, mp2;
for (int p = i; p <= j; ++p) {
s1.push_back(r2[p]);
mp1[r2[p]] = 1;
s2.push_back(r1[p]);
mp2[r1[p]] = 1;
}
for (int p = 0; p < len; ++p) {
if (!mp1[r1[p]]) {
s1.push_back(r1[p]);
mp1[r1[p]] = 1;
}
if (!mp2[r2[p]]) {
s2.push_back(r2[p]);
mp2[r2[p]] = 1;
}
}
return {s1, s2};
}
変異#
一定の確率でランダムに 2 つの遺伝子を選択して交換します。
//変異
void bianYi(Rst &r) {
double rd = randf();
if (rd < 0.01) {
int len = r.size();
int i = rand() % len;
int j = rand() % len;
int t = r[i];
r[i] = r[j];
r[j] = t;
}
}
実行テスト#
私たちは 174 の都市座標を含むテストデータをランダムに生成しました。下の図は 1000 回の繁殖後の最適解(赤)と集団の平均解(緑)です。
データ:https://gist.github.com/zhufengning/3a617fc3f3765cd192d42fb27ee374d0
完全なコード#
#include <cmath>
#include <cstdio>
#include <cstdlib>
#include <ctime>
#include <iostream>
#include <unordered_map>
#include <utility>
#include <vector>
using namespace std;
const int SIZE = 1000, CNT = 1000;
using Pos = pair<double, double>;
using Rst = vector<int>;
vector<Pos> a;
double ans = 1e9;
double notans = 1e9;
double geneSum = 0;
int geneCnt = 0;
Rst ans_rst;
//ランダムな浮動小数点数を取得、0~1
double randf() {
return static_cast<float>(rand()) / static_cast<float>(RAND_MAX);
}
//ランダムに解を生成
Rst randGene(int n) {
Rst ret;
unordered_map<int, bool> mp;
for (int i = 1; i <= n; ++i) {
int newr = rand() % n;
while (mp[newr])
newr = rand() % n;
ret.push_back(newr);
mp[newr] = true;
}
return ret;
}
//2点間の距離
double getDis(Pos p1, Pos p2) {
return sqrt(pow(p1.first - p2.first, 2) + pow(p1.second - p2.second, 2));
}
//移動した総距離
double getValue(Rst &g) {
int len = g.size();
double s = 0;
for (int i = 1; i < len; ++i) {
s += getDis(a[g[i - 1]], a[g[i]]);
}
s += getDis(a[g[0]], a[g[len - 1]]);
if (s < ans) {
ans = s;
ans_rst = g;
}
if (s < notans)
notans = s;
geneSum += s;
geneCnt++;
return s;
}
//適応度
double getShiYingDu(Rst &g) { return 1.0 / getValue(g); }
//選択、二元トーナメント
Rst &choose(vector<Rst> &pool) {
int len = pool.size();
int i = rand() % len;
int j = rand() % len;
int big = getShiYingDu(pool[i]) > getShiYingDu(pool[j]) ? i : j;
return pool[big];
}
//順序交叉(Order Crossover)
pair<Rst, Rst> oxCross(Rst &r1, Rst &r2) {
int len = r1.size();
int i = rand() % len, j = i + rand() % (len - i);
Rst s1, s2;
unordered_map<int, bool> mp1, mp2;
for (int p = i; p <= j; ++p) {
s1.push_back(r2[p]);
mp1[r2[p]] = 1;
s2.push_back(r1[p]);
mp2[r1[p]] = 1;
}
for (int p = 0; p < len; ++p) {
if (!mp1[r1[p]]) {
s1.push_back(r1[p]);
mp1[r1[p]] = 1;
}
if (!mp2[r2[p]]) {
s2.push_back(r2[p]);
mp2[r2[p]] = 1;
}
}
return {s1, s2};
}
//変異
void bianYi(Rst &r) {
double rd = randf();
if (rd < 0.01) {
int len = r.size();
int i = rand() % len;
int j = rand() % len;
int t = r[i];
r[i] = r[j];
r[j] = t;
}
}
int main() {
int n;
scanf("%d", &n);
for (int i = 1; i <= n; ++i) {
double tx, ty;
scanf("%lf%lf", &tx, &ty);
a.push_back(make_pair(tx, ty));
}
//上記はデータ入力部分
//全体の集団
vector<Rst> pool;
//ランダムな染色体を生成
for (int i = 1; i <= SIZE; ++i)
pool.push_back(randGene(n));
//CNT世代の繁殖を行う
for (int i = 1; i <= CNT; ++i) {
//このラウンドの統計データを初期化
notans = 1e9;
geneSum = 0;
geneCnt = 0;
printf("%d ", i);
//適応度配列
vector<double> score;
//新しい集団
vector<Rst> new_pool;
for (int i = 1; i <= CNT / 2; ++i) {
//2つの親を選択
auto win1 = choose(pool);
auto win2 = choose(pool);
//20%の確率で交叉を行う
if (randf() < 0.2) {
auto children = oxCross(win1, win2);
win1 = children.first;
win2 = children.second;
}
//変異を試みる、1%の確率で変異
bianYi(win1);
bianYi(win2);
//新しい集団に挿入
new_pool.push_back(win1);
new_pool.push_back(win2);
}
//このラウンドの結果を出力
printf("%lf %lf %lf\n", ans, notans, geneSum / geneCnt);
//集団の変化
pool = new_pool;
}
//最適解の染色体を出力
for (int v : ans_rst)
printf("%d ", v);
return 0;
}